一般無癥狀。下方虹膜，近瞳孔緣區域好發。臨床上分為2種類型：局灶性虹膜痣和彌漫性虹膜痣。
1.局灶性虹膜痣 虹膜近瞳孔緣或中周部、周邊部、偶見房角處。大小不一，邊界清晰，輕度隆起，一般為棕黑或深黑色,色素變異較大，典型的虹膜痣無血管。絕大多數虹膜痣穩定不發展，極少數可影響鄰近組織，近瞳孔緣虹膜痣可致瞳孔變形，瞳孔緣色素外翻，但並不表明虹膜痣惡變。
2.彌漫性虹膜痣 較扁平，常累及整個或部分虹膜。有些是虹膜痣綜合征(Cogan-Reese綜合征)的一種臨床表現。Cogan-Reese綜合征與原發性虹膜萎縮，Chandler綜合征同歸於虹膜角膜內皮綜合征(iridocorneal endothelial syndrome，ICE綜合征)，臨床表現為單眼青光眼、角膜水腫、虹膜異色、虹膜基質粗糙外露、虹膜多發結節、瞳孔變形、瞳孔緣色素外翻、虹膜周邊前粘連等。其病理機制為特發性角膜內皮增生伴有繼發性虹膜病變。
通過裂隙燈顯微鏡檢查即可確定虹膜痣的診斷，比較容易。
1、虹膜病變患者不宜吃的食物
不吃瓜子、花生、不吃辣椒。
2、虹膜病變患者食療偏方
1)芥菜30克，煎汁、滴眼，每日2—3次。或：薺菜根30—60克，煎湯溫服，每日2—3次。
2)老黃瓜1根，金銀花40克，水煎服，每日2—3次。
3)霜桑葉30克，草決明20克，茶葉3克，水煎服，每日2—3次。
4)秦皮15克，鮮丁香花5克，水煎服。每日2—3次。
5)野菊花20克，黃芩15克，桃仁12克，水煎服，每日2—3次。
6)柴胡、桂枝、丹皮、菖蒲、鮮薑各10克，炙甘草6克，水煎服。每日2次。同時用1%阿托品液點眼。
7)鹽黃伯、鹽知母各30克，曬幹，共研細末，每晚用溫開水、送服9克。同時用1%阿托品液點眼。保持眼瞳子充分散大。
組織病理學表現：色素痣多位於虹膜淺基質層，可稍微向前房內隆起。大多數虹膜色素痣為分化良好的小梭形痣細胞組成，或摻雜少許小圓形痣細胞，細胞內含有不同數量的黑色素顆粒。此種形態的色素痣稱為梭形細胞色素痣。少數虹膜色素痣體積較大，深黑色，其主要由大圓形黑色素細胞組成，胞質內含有豐富的黑色素顆粒，此類細胞組成的色素痣又稱為黑色素細胞瘤或大細胞樣痣。梭形痣細胞之間通常黏附比較緊密，不易脫落。但大圓形黑色素細胞之間黏附疏松，易發生自發性壞死、脫落或累及虹膜角膜角組織，導致繼發性青光眼。
超聲生物顯微鏡檢查：有助於與虹膜黑色素瘤相鑒別。虹膜痣UBM表現為虹膜異常隆起，邊界清晰但不規則。內反射均勻，部分病例表面呈“臍樣”改變或稱為“火山口”樣改變。病變後界欠清晰，可有輕度的聲衰減。