組織病理：惡性小汗腺汗孔瘤可見於小汗腺汗孔瘤或純粹表皮內小汗腺汗孔瘤毗鄰處。
在良性小汗腺汗孔瘤毗鄰處見間變細胞，具有大而染色深，不規則形核，亦可見多核細胞，細胞內富含糖原。原發腫瘤的惡性細胞可限局於表皮或可擴展至真皮內。真皮內有一些遊離的瘤細胞島。由於表皮內有許多界限清楚的瘤細胞巢增生，所以表皮常有相當的棘層肥厚。表皮及真皮細胞巢中可見囊腔。
皮膚轉移時，表皮和真皮內均有很多瘤細胞巢，表皮中界限清楚的大小瘤細胞巢由增生的表皮鱗狀細胞圍繞，呈“濕疹樣癌”樣方式。真皮內某些瘤巢位於擴大的淋巴管內，提示腫瘤在皮膚淋巴管內擴散。由於腫瘤細胞的“向表皮性”，腫瘤細胞可侵入其上表皮。