(一)發病原因 嗜酸性粒細胞性膀胱炎的病因尚不清楚。但多認為與各種刺激，例如細菌、藥物、異體蛋白及食物性變應原等有關。這些變應原作為免疫刺激物，在膀胱形成免疫復合物，導致嗜酸細胞浸潤，破壞膀胱組織，繼而引起溶酶體釋放，使膀胱炎癥進一步加重。可能與本病有關的食物性變應原包括：桔子、西紅柿、巧克力、茶、咖啡、可可、牛奶、多種佐料等。有的病人發現，在飲食中停用上述食物和飲料，其癥狀明顯減輕，發作次數明顯減少。可能與之有關的藥物有磺胺藥、雙香豆素鈉、水楊酸鈉等。另外，避孕套、陰道栓和殺精子膠凍均可為接觸性變應原。血吸蟲卵沉積於膀胱壁，可形成血吸蟲性嗜酸性肉芽腫。藥物和食物性變應原易導致彌漫性膀胱炎，而寄生蟲引起的損害則為局部性。
(二)發病機制 膀胱黏膜紅斑、水腫、潰瘍、天鵝絨樣改變。如為增生性損害時可類似乳頭狀瘤和葡萄狀肉瘤，有時見有黃豆粒或綠豆粒大小的結節，或呈細顆粒狀突起。輸尿管下端受累變窄，可引起雙側腎輸尿管積水。活檢發現纖維化、局部壞死，膀胱全層有大量嗜酸細胞浸潤，有的為膀胱嗜酸性肉芽腫。