本征歸類較混亂,須鑒別的有以下綜合征。
1.Turner綜合征 顯然本質差別是女性,先天性卵巢發育不全,染色體核型主要是45,XO。
2.異型Turner綜合征 Turner綜合征是卵巢呈纖維條索狀不發育。而本綜合征是有一側睪丸發育但不完善,也稱Turner男性假兩性畸形。
3.Noonan綜合征 曾有人將男性Turner綜合征歸類於Noonan綜合征。相似之處是男性Turner綜合征臨床特征的頭4點均符合。需指出的是:①Noonan綜合征男女均可發病;②主要表現為先天性心臟病,而性腺發育不全不一定存在,性腺可不發育到正常發育;③特別應指出的是染色體核型正常(詳見Noonan綜合征)。
4.Bonnevie-Ullrich綜合征 有人曾認為男性Turner綜合征就是本征。主要有以下幾點可供參考:①本征男女均可發病;②乳兒期有特征性的淋巴管擴張性水腫;③其主要異常可能是結締組織受累,而先心病不是主要畸形;④染色體核型正常。