(一)發病原因
真菌性肉芽腫屬深部真菌感染，因此凡能引起深部組織感染的真菌，均可以是本病的致病菌，如新型隱球菌、曲黴菌、球孢子菌、類球孢子菌、諾卡菌、放線菌、莢膜組織胞漿菌、芽坐菌、分子孢子菌、念珠菌、波伊德黴樣真菌、藻菌等，但以隱球菌、曲黴菌和放線菌多見。近年來，由於抗生素、激素和免疫抑制劑在臨床上廣泛應用，器官組織移植手術推廣，以及醫務人員對真菌病認識的提高，真菌感染的發生率有增加趨勢。在自然界中真菌分佈很廣泛，很多真菌是條件致病菌，寄生在人體中，當人體抵抗力降低時，它們乘虛而入，可侵犯肺、腦膜和腦、脊髓、皮膚、淋巴結、腸、肝、脾、腎上腺等臟器等。真菌入侵腦的方式，常先從呼吸道吸入，形成肺部病灶，再由肺經血行播散於全身器官和入顱，少數真菌(如曲黴菌、放線菌和芽生菌)可經頭面部的口腔、鼻腔、鼻旁竇、眼眶、脊椎骨等處的病灶直接侵入中樞神經系統，個別病例可經腰穿、手術植入而發生腦部真菌感染。患有單核巨噬細胞系統惡性腫瘤、糖尿病等病人較易發生本病。新型隱球菌是隱球菌屬於惟一的致病菌，對中樞神經系統有特殊的親和力，也是顱內真菌感染中最常見的一種。
(二)發病機制
真菌常由呼吸道侵入人體內形成病灶，在由肺部經血液循環播散到腦及腦膜。少數真菌如毛黴菌、放線菌可經五官、顱骨、脊椎骨病灶直接侵入腦脊膜。個別病例可經腰椎穿刺發生感染。
感染使腦膜局限性或廣泛性形成不規則的肉芽腫，有淋巴細胞、漿細胞或多核巨細胞浸潤。腦呈不同程度的水腫，真菌沿血管周圍和軟腦膜下聚集，形成多數小囊樣病灶，呈急性或慢性化膿性炎癥反應，甚至形成腦膿腫或肉芽腫，多位於腦實質內，偶見腦室內。在膿腫和肉芽腫中可見大量真菌體或菌絲。不同種類的真菌感染，引起的病理變化也不相同，白色念珠球菌常引起小灶性化膿和肉芽腫，隱球菌早期形成膠凍樣病變，無纖維包膜，晚期則形成肉芽腫，放線菌主要形成多發性膿腫和肉芽腫，膿腫壁呈黃色，膿液含“硫磺顆粒”。慢性病程者常有廣泛腦萎縮。
在臨床上正確地使用抗生素、激素和免疫抑制劑，對於器官組織移植和免疫功能低下的患者，也應積極預防感染的發生。
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中藥材查詢腦真菌性肉芽腫西醫治療方法(一)治療
真菌感染一旦形成肉芽腫，藥物治療則難以消除，手術切除為主要手段，但手術前後都需要抗真菌藥物治療，並對原發感染灶進行系統治療。
1.開顱病灶切除術 手術方法同腦結核球、腦結核性肉芽腫。術前、術後皆需繼續藥物治療。
2.藥物治療 目前治療真菌的藥物有兩性黴素B、氟康唑、氟胞嘧啶等。對不同的真菌需用不同的藥物，可以合並用藥，如隱球菌致病可用兩性黴素B和氟康唑合用，則療效更佳。
(1)兩性黴素B：目前仍是治療中樞神經系統隱球菌感染的首選藥物，首次劑量1mg/d，靜脈滴入，註意本藥禁忌溶於生理鹽水中。以後根據病人的耐受性每天增加2～5mg，直至1mg/(kg·d)，但濃度不能超過0.1mg/ml，每次靜脈滴入的時間至少6h，並避光。如用藥期間副作用明顯，則不宜繼續加量，嚴重者須停藥數天，一次用藥可維持24～48h，故可每天或隔天1次。治療期間可每周做腰椎穿刺，送腦脊液培養，培養陰性後再持續治療4周。
如療效不佳或腎功能不良需減量時，可采用鞘內或腦室內註射，0.1mg加1～2ml註射用水，再用腦脊液5ml稀釋，緩慢註入並反復用腦脊液稀釋，可逐漸加量直至達0.5mg，每周可重復2～3次，但總量不能超過1.5mg。
毒性反應包括發熱、寒戰、惡心、嘔吐、食欲不振、全身酸痛和靜脈炎等，個別病人可出現不同程度的肝、腎功能損害、血小板減少、心律失常和血鉀降低等，如用藥前加用地塞米松和異丙嗪(非那根)等，可減輕副作用，但須治療量已加足時再用激素，以免真菌擴散。
新型隱球菌合成莢膜時需要硫胺，故應用兩性黴素B治療過程中避免使用硫胺，並註意低硫胺飲食3個月以上。
(2)氟胞嘧啶：口服有效，且能通過血-腦脊液屏障，劑量為50～150mg/kg，分次每6小時服用1次。本藥最好以每天150mg/kg與兩性黴素B 0.3mg/(kg·d)的劑量合用，既可以減少兩性黴素B的毒性，還可以減少真菌耐藥性的出現，全療程共6周。最嚴重的副作用為骨髓抑制，此時可以單獨使用兩性黴素B治療。
(3)咪康唑：是廣譜抗真菌藥，毒性低，較安全，開始用200mg溶於50～100ml靜脈註射用溶液中，15～30min內滴完。常用劑量1200～2400mg/d，分3次每8小時註入1次，加入5%葡萄糖或生理鹽水溶液250～500ml中，30min以上滴完，3～12周為一個療程。對病人最好做心電圖監測，以保證不發生不良的心臟反應，嚴重病例可同時鞘內註射，每次20mg，3～7天1次。
(二)預後
如能采取及時有效的藥物治療，同時手術切除肉芽腫，預後良好。
藥療是根本，而食療能輔助藥物的治療，那麼腦真菌性肉芽腫的食療和飲食又是怎麼樣的？
藥品查詢腦脊液壓力正常或增高，外觀澄清或微濁，白細胞數輕至中度增多(20～700)×106/L以上，以淋巴細胞和中性粒細胞為主。蛋白質含量增高，糖含量降低，氯化物輕至中度降低，一般不低於85mmol/L。50%～80%的病例腦脊液墨汁染色可見帶有莢膜的圓形隱球菌。應用酶聯免疫吸附試驗大約90%以上的病例血清或腦脊液中可以查出莢膜抗原。乳膠顆粒凝集試驗有相當高的特異性，在診斷上有很高的價值。
1.CT掃描 ①腦基底池及外側裂失去正常低密度，密度增高，為滲出物占據，明顯強化;②腦動脈炎引起腦梗死，呈低密度灶;③腦膜粘連致交通性或梗阻性腦積水;④基底節與丘腦多發囊性灶，不強化，有特異性。⑤腦實質內的肉芽腫CT平掃時呈等或高密度影像，增強後顯示大小不一，多發的、邊界銳利、明顯強化的結節，或呈不均勻強化、環形強化，周圍伴有或不伴有水腫。
2.MRI掃描 腦基底池的T1和T2弛豫時間縮短，增強後表現為明顯強化，與低信號的腦組織間形成良好的對比。腦實質的肉芽腫在T2加權像上呈等或略低信號，T2加權像上腦表面表現為多發的、直徑約5mm的低信號。